Le mythe de l’Atlantide n'a qu'une source : Platon. Il décrivait, il y a quelques 2500 ans, un pays regorgeant de richesses, situé au delà des colonnes d’Hercule, dont la capitale aurait été anéantie par un séisme, puis engloutie dans les profondeurs de la mer. À la suite d'une miraculeuse photo aérienne, le commandant Cousteau se retrouve sur les traces de la civilisation perdue de la légende de l’Atlantide. Près de l'île de Dia, l'équipe fait une découverte extraordinaire…